MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 5192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015713	A	8	8	1	8	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015713	A	6	6	23	28	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015713	ATT	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015713	A	6	6	1369	1374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015713	CAA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015713	T	6	6	1425	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015713	AAT	2	6	1485	1490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015713	TTA	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015713	AAT	2	6	2362	2367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015713	AT	3	6	2394	2399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015713	TTA	2	6	2430	2435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015713	AGA	2	6	8902	8907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015713	TCT	2	6	8912	8917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015713	AATG	2	8	8920	8927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015713	TC	3	6	8971	8976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015713	AGGT	2	8	9012	9019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015713	CAA	2	6	9165	9170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015713	TC	3	6	9201	9206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015713	ATA	2	6	9211	9216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015713	TGA	2	6	9314	9319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015713	A	7	7	9357	9363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015713	GA	3	6	9452	9457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015713	CTC	2	6	9462	9467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015713	CT	3	6	9550	9555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015713	TGA	2	6	9624	9629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015713	AAT	2	6	9649	9654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015713	GGAA	2	8	9655	9662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015713	C	6	6	9702	9707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_015713	AGG	3	9	9713	9721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015713	A	6	6	10172	10177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015713	AGAC	2	8	10698	10705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015713	TC	3	6	10717	10722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015713	TTG	2	6	10740	10745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015713	AAT	2	6	10775	10780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015713	CTT	2	6	10783	10788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015713	TGGT	2	8	10804	10811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015713	AATT	2	8	10817	10824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015713	A	8	8	10843	10850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015713	A	6	6	10858	10863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015713	TAA	2	6	10864	10869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015713	TAA	2	6	11870	11875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015713	TCT	2	6	11929	11934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015713	A	7	7	11999	12005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015713	GA	3	6	12094	12099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015713	CTC	2	6	12104	12109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015713	CT	3	6	12192	12197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015713	TGA	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015713	AAT	2	6	12291	12296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015713	GGAA	2	8	12297	12304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015713	C	6	6	12344	12349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_015713	AGG	3	9	12355	12363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015713	GCAAT	2	10	12429	12438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015713	AGT	2	6	12529	12534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015713	ATG	2	6	12558	12563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015713	TTC	2	6	12668	12673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015713	GTC	2	6	12732	12737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015713	ATGGA	2	10	12772	12781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015713	A	6	6	12814	12819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015713	AATC	2	8	13576	13583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015713	TA	3	6	13872	13877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015713	AT	3	6	13883	13888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015713	T	6	6	13900	13905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015713	T	7	7	14231	14237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015713	AAG	2	6	15028	15033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015713	CAT	2	6	15041	15046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015713	CTA	2	6	15111	15116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015713	TTC	2	6	15132	15137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015713	ATAA	2	8	15161	15168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015713	T	6	6	15189	15194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015713	CTT	2	6	15195	15200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015713	TGA	2	6	15205	15210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015713	TGA	2	6	15248	15253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015713	GAT	2	6	15275	15280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015713	AAG	2	6	15290	15295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015713	T	7	7	15310	15316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015713	GC	3	6	15465	15470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015713	GAAC	2	8	15477	15484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015713	AAGA	2	8	15550	15557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015713	CAA	2	6	15562	15567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015713	A	7	7	15577	15583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015713	CAT	2	6	15592	15597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015713	AT	3	6	15639	15644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015713	A	6	6	15689	15694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015713	ATC	2	6	15782	15787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015713	A	6	6	15796	15801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015713	GAT	2	6	15806	15811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015713	GTT	2	6	15837	15842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015713	T	8	8	15841	15848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015713	A	6	6	15854	15859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015713	T	9	9	15879	15887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015713	ATT	2	6	15961	15966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015713	GATT	2	8	15992	15999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015713	TTGA	2	8	17689	17696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015713	TGT	2	6	17714	17719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015713	TAAT	2	8	17976	17983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015713	AT	3	6	18031	18036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015713	TAT	2	6	18052	18057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015713	ATTA	2	8	18072	18079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015713	A	7	7	18090	18096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015713	GA	3	6	21056	21061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015713	T	6	6	21095	21100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015713	CTT	2	6	21105	21110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015713	CT	3	6	29298	29303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015713	CAA	2	6	29375	29380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015713	TTA	2	6	29381	29386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015713	T	6	6	29387	29392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015713	CTT	2	6	29433	29438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015713	TAA	2	6	29495	29500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015713	T	7	7	29581	29587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015713	CT	3	6	31662	31667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015713	A	6	6	31674	31679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015713	A	8	8	31712	31719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015713	TTTG	2	8	31736	31743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015713	GCCCTG	2	12	31759	31770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015713	TTAA	2	8	31774	31781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015713	A	7	7	31813	31819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015713	AGG	3	9	34269	34277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015713	CT	3	6	34279	34284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015713	TCT	2	6	34304	34309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015713	ATG	2	6	34315	34320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015713	TGTA	2	8	37859	37866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015713	ATT	2	6	37875	37880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015713	GAA	2	6	37895	37900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015713	TTC	2	6	37940	37945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015713	TTC	2	6	39671	39676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015713	T	8	8	39714	39721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015713	T	7	7	39731	39737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015713	ATT	2	6	39748	39753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015713	TGC	2	6	39768	39773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015713	AGG	2	6	39791	39796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015713	T	8	8	42868	42875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015713	TCT	2	6	46797	46802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015713	AAGA	2	8	46844	46851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015713	A	7	7	47954	47960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015713	CAAA	2	8	47973	47980	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015713	A	6	6	48007	48012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015713	TAAAAT	2	12	48013	48024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015713	CA	3	6	48026	48031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015713	GAAT	2	8	50599	50606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015713	T	8	8	56108	56115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015713	A	6	6	56166	56171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015713	A	10	10	57506	57515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015713	AAC	2	6	57518	57523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015713	TTTTC	2	10	57553	57562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015713	CGA	2	6	61981	61986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015713	GA	3	6	62327	62332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015713	AAG	2	6	62404	62409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015713	TTA	2	6	63020	63025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015713	A	6	6	65925	65930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015713	GAA	2	6	70406	70411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015713	TAAAA	2	10	70414	70423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015713	CTT	2	6	70431	70436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015713	T	6	6	70468	70473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015713	GGA	2	6	70474	70479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015713	T	7	7	70747	70753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015713	GTA	2	6	71805	71810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015713	AAT	2	6	71832	71837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015713	TTG	2	6	71850	71855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_015713	CCT	2	6	72019	72024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_015713	TAA	2	6	72030	72035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015713	A	6	6	72043	72048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015713	AAAG	2	8	72071	72078	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015713	TAA	2	6	75227	75232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015713	AGGTC	2	10	75235	75244	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_015713	TCT	2	6	75258	75263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_015713	GA	3	6	75332	75337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015713	A	6	6	75395	75400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015713	T	8	8	75448	75455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015713	T	6	6	75458	75463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015713	TGA	2	6	75504	75509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015713	CAA	2	6	75545	75550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_015713	A	6	6	75596	75601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015713	AGA	4	12	75629	75640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_015713	TTCTT	2	10	75658	75667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
178	NC_015713	CTTTTT	2	12	78220	78231	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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181	NC_015713	A	8	8	78279	78286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015713	AAT	2	6	78302	78307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_015713	T	6	6	78532	78537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015713	AAT	2	6	78538	78543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015713	T	6	6	78546	78551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015713	GTT	2	6	78572	78577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_015713	TAA	2	6	78608	78613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015713	TAG	2	6	78670	78675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_015713	A	7	7	81000	81006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015713	AGTTT	2	10	81016	81025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015713	A	8	8	81030	81037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015713	AGG	2	6	81060	81065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015713	T	7	7	83172	83178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_015713	T	6	6	93595	93600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_015713	TAA	2	6	141827	141832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_015713	ATTC	2	8	193180	193187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
437	NC_015713	TAA	2	6	193197	193202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_015713	TAT	2	6	193517	193522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_015713	TAA	2	6	193533	193538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_015713	A	7	7	193555	193561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015713	TAA	2	6	193574	193579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015713	TAA	2	6	193591	193596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_015713	AGA	2	6	197675	197680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015713	TAC	2	6	197698	197703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_015713	AGC	2	6	198070	198075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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456	NC_015713	ATT	2	6	198509	198514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_015713	AAT	2	6	198561	198566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_015713	T	7	7	209208	209214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_015713	GA	3	6	209245	209250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_015713	T	6	6	214842	214847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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